Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOP08100 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOP08100 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOP08100 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOP08100 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOP08100 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOP08100 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOP08100 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOP08100 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOP08100 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOP08100 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOP08100 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOP08100 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOP08100 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOP08100 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOP08100 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOP08100 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms