Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN1P07384 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms