Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1AO95602 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms