Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGTAO43765 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGTAO43765 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGTAO43765 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGTAO43765 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGTAO43765 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGTAO43765 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGTAO43765 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGTAO43765 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms