Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MTSS1O43312 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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MTSS1O43312 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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MTSS1O43312 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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MTSS1O43312 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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MTSS1O43312 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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MTSS1O43312 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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MTSS1O43312 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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MTSS1O43312 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTSS1O43312 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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