Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms