Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms