Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KNCNA6PVL3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms