Protein–RNA interactions for Protein: A4D1Z8

GRIFIN, Grifin, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIFINA4D1Z8 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GRIFINA4D1Z8 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms