Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms