Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms