Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms