Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms