Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms