Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD1BQ9P298 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms