Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms