Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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