Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms