Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN4Q9NQP4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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