Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms