Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms