Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CIPCQ9C0C6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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