Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM4Q9C037 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms