Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM8Q9BZR9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms