Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms