Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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