Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms