Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms