Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LPIN3Q9BQK8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms