Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELF4Q99607 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms