Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD180Q99467 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD180Q99467 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD180Q99467 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD180Q99467 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD180Q99467 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD180Q99467 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD180Q99467 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD180Q99467 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD180Q99467 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD180Q99467 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms