Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NAP1L3Q99457 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms