Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZC2HC1AQ96GY0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms