Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCAMP4Q969E2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms