Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms