Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CFAP61Q8NHU2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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