Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATL2Q8NHH9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms