Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms