Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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CLDN19Q8N6F1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CLDN19Q8N6F1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CLDN19Q8N6F1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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