Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPAP2Q8IXW5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms