Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms