Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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