Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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