Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC149Q6ZUS6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms