Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q6P435 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q6P435 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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