Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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C9orf135Q5VTT2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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C9orf135Q5VTT2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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C9orf135Q5VTT2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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C9orf135Q5VTT2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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C9orf135Q5VTT2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf135Q5VTT2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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