Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 HIST1H2AA-201ENST00000297012 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 UBE2C-205ENST00000372568 914 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 AC016956.1-201ENST00000393026 1108 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 KIF3AP1-201ENST00000454055 611 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 SEC11A-202ENST00000455959 1223 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 AF250324.1-202ENST00000511785 979 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 UBE2N-206ENST00000552442 607 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 AC010809.2-201ENST00000560404 964 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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C4orf48Q5BLP8 AC022884.1-201ENST00000578490 577 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 AC010615.2-201ENST00000596705 566 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 PPP3CB-AS1-211ENST00000600887 489 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 C18orf12-201ENST00000623329 537 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 LINC01132-202ENST00000641214 1085 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 COPS5-201ENST00000357849 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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C4orf48Q5BLP8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 AP002957.1-203ENST00000526091 1897 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C4orf48Q5BLP8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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