Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms