Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETM2Q2VYF4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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