Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL67

PARP6, Poly [ADP-ribose] polymerase 6, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP6Q2NL67 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARP6Q2NL67 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms